一般洁净室通风量非常大，电子烟灌装车间百级洁净室换气次数可达数百次/h。送风量大导致耗电多。洁净室的能量消耗是写字楼的10~30倍。因此加强洁净室的能源管理十分必要且空间巨大。
AIRKEY冠航洁净室空调的节能从设计之初就开始考虑：
1.采用高效率的泵、压缩机和风扇马达。
不仅是空调，对于24小时使用的设备，多宜采用高效率的产品，虽然初期成本高，但因使用时间长且效率高，故投资成本的回收时间比较短。
2.导入新风先处理。
为了维持适当的室压，势必导入足够的新风，因此，在夏季，「新风」是生产机器热负荷以外的另一大热负荷，而新风热负荷是以潜热为主，对于新风需求大的洁净室，宜以独立的空调箱处理新风热负荷后，再使新风与回风混合而进入AHU主空调箱。
3.可变风量（变频）系统的采用。
新滤网的压损小，使用一段时间后，压损逐渐增加，因此洁净室施工完了时的供风量可能比设计量多20%~40%（这也是多数洁净室在验收时洁净度奇佳的主因），故宜搭配自动变频系统，若嫌费用高，至少在使用初期宜适度关小风门，并定期检查洁净度及风量，再适时逐渐放大风门。
4.采用低压损的AIRKEY冠航过滤器。
设计之初，若用高压损的过滤网，加上风管本身的摩擦损失，则风扇静压可能需高达125mmAq以上。因此，必需采用大马力的风车马达。采用低压损AIRKEY的滤网，虽然可能“贵了一些”，但可采用较小马力的风车马达，且日后的运转费用亦较低，是绝对值得的。
5.AHU空调箱与AIRKEY-FFU搭配使用。
洁净室的换气量远大于一般空调的换气量，亦即若以风量来选择AHU空调箱的冷冻能力，则将使空调箱超大。同时在不生产的轻冷房负荷且低污染期间中，若使空调箱全风量运转，其浪费能源颇巨。因此空调箱以拥有处理冷房负荷的必要风量即可，其余不足的风量，再选用适当（含HEPA）AIRKEY-FFU配合使用，则在可节省许多不生产期间的空调电力。
6.配合室内独立的除湿机使用。
对于不生产期间，因没有生产机器热负荷，可能相对湿度偏高，而温度偏低。若以纯空调箱应付，将浪费大量的风扇电力与加热电力（能源），倘在室内装设适当能力的除湿机，则可节省不少的电力。
7.风管足够保温不漏气。
洁净室风管的静压高，其施工方式与品质要求均较一般空调的低压风管严谨，而风管工程又是最容易偷工减料的一环，因此业主千万勿贪“大便宜”而选错承包商，否则后悔莫及；日后风管严重漏气、洁净度差或温湿度控制不佳时，可能劳力伤财又难以改善。业主宜重品质依4-3的说明，严格要求督导。
8.迅速局部排热、排尘。
基于「速排除」的原则，对于机器所产生的高热与尘埃，必需强制排除，以避免在室内扩散。对于集尘罩及集热罩必需妥善规划，不少场合只会因吸入罩不佳或位置不对，而使热与尘埃扩散至室内各处，增加空调负荷，并影响洁净度。
9.合宜的温湿度精度要求。
有些精密加工过程，确实要求高精密度（例：±0.5℃db与±3%RH），但大多数的场合，可能仅严格要求洁净度及落菌量，对温湿度并无特别要求，多数在一般空调的24±3℃db及60%±15%RH即可，因此业主除非确实了解自己产品的要求，否则，不宜自定精度要求。大体上±2%℃db与±5%RH的精度要求，即需加装加湿器、加热器及精密的控制设备，无形中增加巨额的初期成本与运转成本。
10.冰水机宜50%设计能力x3台（至少2台）并联使用。
洁净室空调24小时使用，故在规划时实不宜只考量初期成本，而选用一台100%能力的冰水机。若故障时，则业主无法生产的损失是难以估算的。故冰水机宜采用50%设计能力x3台并联使用，而且，压缩机宜有适当的卸载能力，使压缩机马达的消耗电力能随冷房负荷能力的降低而减少。
11.非生产期间的空调运转管理。
这是洁净室空调能源管理的一大死角，在初期成本挂帅的前提下，（设计）承包商大多没有采用自动控制管理的方式，因此业主只有依赖「人力」勤加管理。非生产期间大多不需要维持生产期间的温湿度，故非生产期间的温湿度控制宜「回调」（Set Back），例如：若生产时要求22℃db，50%RH，在非生产期间若回调位26℃db，60%RH，加上非生产期间的污染少，换气次数亦可减少，则可降低风车组、冷却塔、冷却泵、冰水泵与冰水机的负载率，以节省可观的空调电力。
一个洁净室要实现节约能量消耗，获得较好的经济效益、社会效益和环境友好，既是容易的、也是困难的。只要洁净室的设计者、建造者、运营人，最主导的是所有者——业主，从洁净室的规划、设计开始，就十分注重“节能”、提出“要求”，并多支付“小量”投资，就可能获得“巨大”的社会经济“回报”（效益）。目前已经有一些实用的洁净室节能减排的应用技术，能否应用，只等“有心人”了！
